More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03248 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03248  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 635 aa  1228    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1015  methyl-accepting chemotaxis protein  47.88 
 
 		 641 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 		 642 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0858408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.39 
 
 		 642 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1451  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 		 648 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 698 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 		 650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.571634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 		 631 aa  249  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 		 644 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 639 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.27 
 
 		 642 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 		 660 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.83 
 
 		 555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.06 
 
 		 588 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 737 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.84 
 
 		 660 aa  111  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 		 519 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  30.68 
 
 		 660 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  30.75 
 
 		 660 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.39 
 
 		 571 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.19 
 
 		 659 aa  107  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 661 aa  107  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  33.02 
 
 		 660 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  33.64 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  33.64 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  33.64 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  33.64 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  33.64 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  32.11 
 
 		 660 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.63 
 
 		 572 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 		 297 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.72 
 
 		 662 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.11 
 
 		 823 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 646 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1487  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 659 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000879913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 		 588 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0528204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0356  methyl-accepting chemotaxis protein  31.68 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0339  methyl-accepting chemotaxis protein  31.68 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0342  methyl-accepting chemotaxis protein  31.68 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0370  methyl-accepting chemotaxis protein  31.68 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 565 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 673 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.506738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.13 
 
 		 631 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 		 417 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 		 430 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.83 
 
 		 525 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.72 
 
 		 678 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 652 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 664 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 598 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 431 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.613067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0469  methyl-accepting chemotaxis protein  31.03 
 
 		 430 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0470  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.25 
 
 		 430 aa  100  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.01 
 
 		 566 aa  100  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 660 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  30.22 
 
 		 658 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 551 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  32.29 
 
 		 660 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0405  methyl-accepting chemotaxis protein  30.07 
 
 		 430 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  32.29 
 
 		 660 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.4 
 
 		 689 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  31.89 
 
 		 650 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  32.29 
 
 		 660 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 673 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000001862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 678 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 		 571 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.72 
 
 		 521 aa  98.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0413099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 541 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.55 
 
 		 574 aa  98.6  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4900  methyl-accepting chemotaxis protein  30.77 
 
 		 430 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0418  methyl-accepting chemotaxis protein  30.77 
 
 		 430 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.82 
 
 		 676 aa  98.2  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5195  methyl-accepting chemotaxis protein  36.04 
 
 		 563 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 		 626 aa  97.8  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.68 
 
 		 572 aa  97.4  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 694 aa  97.8  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  41.77 
 
 		 623 aa  97.8  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.39 
 
 		 713 aa  97.8  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 		 671 aa  97.8  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  31.52 
 
 		 550 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 		 636 aa  97.4  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2692  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 		 768 aa  97.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 		 771 aa  97.4  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 539 aa  97.1  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 539 aa  97.1  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  30.07 
 
 		 658 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  31.68 
 
 		 629 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5150  chemotaxis signal transducer  35.53 
 
 		 563 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000223621 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4769  methyl-accepting chemotaxis protein  35.53 
 
 		 563 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000157203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.33 
 
 		 695 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  38.3 
 
 		 623 aa  96.3  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 		 675 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 		 701 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.75 
 
 		 563 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.66 
 
 		 430 aa  97.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 541 aa  97.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.7 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>