47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00208 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  100 
 
 
349 aa  724    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  55.95 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  48.82 
 
 
346 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  48.82 
 
 
346 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  48.22 
 
 
346 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  48.22 
 
 
346 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  48.22 
 
 
346 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  46.36 
 
 
350 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  48.22 
 
 
346 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  46.06 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  47.93 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  47.93 
 
 
346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  47.93 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  46.02 
 
 
346 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  46.87 
 
 
351 aa  317  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  46.51 
 
 
351 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  45.67 
 
 
350 aa  315  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  44.64 
 
 
362 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  49.11 
 
 
348 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  47.92 
 
 
348 aa  309  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  44.74 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  42.06 
 
 
360 aa  289  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  43.03 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  38.58 
 
 
345 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  37.09 
 
 
343 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  37.65 
 
 
343 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  36.95 
 
 
347 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  37.5 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  36.18 
 
 
343 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  36.9 
 
 
343 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  36.98 
 
 
347 aa  242  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  34.88 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  32.92 
 
 
346 aa  155  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.7 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  27.02 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  26.93 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  27.13 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  25.62 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  26.4 
 
 
367 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  26.89 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  26.33 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  24.85 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  27.75 
 
 
355 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  22.02 
 
 
371 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  23.18 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  22.95 
 
 
373 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  22.22 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>