28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6500 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 151 aa  292  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  62.03 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  62.03 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  61.33 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  43.24 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  32.11 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  34.07 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0517  hypothetical protein  35.63 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511228  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  39.73 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  39.51 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  41.56 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  33 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  33.75 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  38.16 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1032  hypothetical protein  41.43 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1126  hypothetical protein  41.43 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0546  hypothetical protein  41.51 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0481  hypothetical protein  41.51 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  40.79 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  41.1 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  43.08 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  41.54 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  40.45 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  30.56 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  35.96 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  38.33 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>