218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6357 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  100 
 
 		 389 aa  765    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  89.72 
 
 		 389 aa  683    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  76.05 
 
 		 410 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  75.8 
 
 		 410 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  72.77 
 
 		 390 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  74.14 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  70.18 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  73.39 
 
 		 394 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  68.89 
 
 		 388 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  69.67 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  71.39 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  70.86 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  59.04 
 
 		 393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  48.76 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  43.41 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  41.54 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  42.38 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  39.95 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  41.28 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  40.72 
 
 		 387 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  40.72 
 
 		 387 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  40.72 
 
 		 378 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  40.72 
 
 		 387 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  40.72 
 
 		 387 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  41.15 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  41.15 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  39.74 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  39.74 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  45.02 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  40.44 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  38.07 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  37.7 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  38.07 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  36.29 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  36.29 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  38.56 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  38.2 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  37.23 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  37.98 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  39.3 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  43.48 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  36.29 
 
 		 406 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  39.13 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  37.43 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  35.51 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  35.32 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  34.9 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  32.63 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  32.65 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  32.65 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  31.35 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  35.02 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.77 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.25 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.69 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  27.39 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  27.39 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.39 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  27.39 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.64 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.37 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  28.61 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  27.37 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  27.9 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  27.79 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  27.65 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  25.59 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  27.59 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.66 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.58 
 
 		 397 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.67 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  27.22 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.76 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.78 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.78 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 376 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  28.34 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>