29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3600 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3600  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  100 
 
 		 250 aa  470  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643616  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0138  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  63.86 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4007  LRV FeS4 cluster domain protein  80.88 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0400  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  49.38 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0208  leucine-rich repeat-containing protein  48.96 
 
 		 263 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00966126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2196  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  55.74 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0545  hypothetical protein  55.33 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0115  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  47.9 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1242  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  52.4 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0963  FeS4 cluster protein  48.32 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0395  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  43.5 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0996  leucine-rich repeat-containing protein  47.22 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5107  LRV FeS4 cluster domain protein  48.32 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5900  hypothetical protein  49.37 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0217086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1578  leucine-rich repeat-containing protein  47.15 
 
 		 279 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1067  LRV FeS4 cluster  46.67 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1250  LRV FeS4 cluster domain protein  43.57 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1534  leucine rich repeat protein  43.57 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1408  LRV FeS4 cluster domain-containing protein  45.83 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1449  hypothetical protein  46.44 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3642  LRV FeS4 cluster domain protein  46.67 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1574  LRV FeS4 cluster domain protein  49.39 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1408  leucine-rich repeat-containing protein  40.68 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.558669  normal  0.105067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01440  Nitrogen fixing leucine rich variant repeat 4Fe-4S cluster protein  39.9 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2116  leucine-rich repeat-containing protein  37.83 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4008  LRV Fes4 cluster domain-containing protein  75.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.51 
 
 		 1343 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0869  leucine-rich repeat-containing protein  37.95 
 
 		 463 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3480  hypothetical protein  31.43 
 
 		 373 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>