More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1854 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  42.05 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  44.19 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  37.78 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  34.34 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  38.82 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0328  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000496068  hitchhiker  0.00000000000003303 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.35 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  35.87 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  36.14 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  44.71 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  28.42 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>