More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1656 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1656  integrase catalytic subunit  100 
 
 
223 aa  473  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1339  integrase catalytic subunit  77.13 
 
 
283 aa  374  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1070  integrase catalytic subunit  76.23 
 
 
283 aa  370  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00450828  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0441  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 
254 aa  186  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  32.37 
 
 
239 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  32.37 
 
 
239 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  32.37 
 
 
239 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  32.37 
 
 
239 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1118  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 
269 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2660  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 
269 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306484  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0112  transposase  31.07 
 
 
289 aa  95.5  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0841  transposase  31.07 
 
 
289 aa  95.5  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0546  transposase  31.07 
 
 
289 aa  95.5  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  29.81 
 
 
297 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3065  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4312  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3550  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3189  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4660  integrase catalytic region  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.462988  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2006  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  30.62 
 
 
278 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1073  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4449  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0972291  normal  0.591502 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4460  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4596  integrase catalytic region  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.930794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0132  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2008  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2651  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1727  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1928  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0656  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  29.91 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  27.96 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 
269 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 
269 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 
269 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0374  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0495  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0657  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0684  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0892  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1024  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1079  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1083  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1129  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1134  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1465  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2031  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2056  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2130  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2135  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3398  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3570  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3606  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3610  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4183  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4277  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4294  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4300  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4442  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4580  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0024  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0483506  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  30 
 
 
386 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  30 
 
 
386 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0029  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0037  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  30 
 
 
386 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  30 
 
 
386 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0054  ISSod1, transposase OrfB  30 
 
 
269 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  30 
 
 
386 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0848  transposase  31.07 
 
 
289 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.556417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  28.97 
 
 
296 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>