More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1002 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1002  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 218 aa  455  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0153  integrase catalytic subunit  87.16 
 
 		 322 aa  404  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1916  integrase catalytic subunit  87.16 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1724  integrase catalytic subunit  87.16 
 
 		 322 aa  404  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1044  integrase catalytic subunit  87.16 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.343683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0786  integrase catalytic subunit  87.61 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1584  integrase catalytic subunit  76.78 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00305908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1357  IS30 family transposase  83.96 
 
 		 210 aa  188  7e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  37.37 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  32.42 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  34.18 
 
 		 342 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 		 342 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  34.87 
 
 		 356 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  34.87 
 
 		 356 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  34.95 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  33.67 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  34.95 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  34.95 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  34.95 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  34.95 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  34.95 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  34.95 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  34.95 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  35.06 
 
 		 343 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  36.59 
 
 		 336 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  34.34 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  34.34 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  34.34 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 339 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  34.67 
 
 		 343 aa  95.1  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 335 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 335 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 335 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 335 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  37.75 
 
 		 313 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  36.49 
 
 		 315 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  31.41 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  36.49 
 
 		 315 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  36.49 
 
 		 315 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 251 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  35.76 
 
 		 313 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1130  IS30 family transposase  33.66 
 
 		 305 aa  92.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.679883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1133  IS30 family transposase  33.66 
 
 		 305 aa  92.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 335 aa  92.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  35.76 
 
 		 313 aa  91.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  35.76 
 
 		 313 aa  91.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 		 399 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 		 399 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  35.76 
 
 		 313 aa  91.3  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  35.81 
 
 		 315 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4602  Integrase catalytic region  31.68 
 
 		 333 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.792581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  35.62 
 
 		 386 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  35.62 
 
 		 386 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  37.66 
 
 		 322 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  35.76 
 
 		 313 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  35.76 
 
 		 313 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  35.76 
 
 		 313 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  35.76 
 
 		 313 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  37.66 
 
 		 322 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  37.66 
 
 		 322 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  37.66 
 
 		 322 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  37.66 
 
 		 322 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  37.42 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  37.66 
 
 		 322 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  33.56 
 
 		 380 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  32.8 
 
 		 354 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  32.8 
 
 		 383 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>