82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0996 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0996  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000378189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1592  integrase catalytic subunit  96.88 
 
 		 464 aa  450  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  26.04 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  26.04 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  26.04 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2608  hypothetical protein  32.04 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  23.67 
 
 		 177 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  23.67 
 
 		 177 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 174 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 174 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 174 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 174 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 174 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  25.44 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  25.44 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  25.44 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  25.44 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  23.21 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  24.7 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  23.21 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  23.21 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  28.7 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  23.21 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0858431 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  27.59 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03578  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  27.59 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  27.59 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  27.27 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  27.83 
 
 		 172 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  28.87 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  28.87 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  27.83 
 
 		 172 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  28.87 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  28.87 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  28.87 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  27.59 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  21.69 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  29.48 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  25.62 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  25.62 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  25.49 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  25.49 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  25.49 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  25.49 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  26.21 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  25.49 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  25.49 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  25.49 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  25.49 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  21.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3593  hypothetical protein  41.07 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3342  transposase for IS150  41.07 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  25.49 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  25.49 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  25.49 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  25.49 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  25.49 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  25 
 
 		 142 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>