41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1363 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  99.55 
 
 		 445 aa  882    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  884    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  65.83 
 
 		 449 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  63.36 
 
 		 439 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  61.45 
 
 		 441 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  60.09 
 
 		 440 aa  527  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  57.88 
 
 		 441 aa  518  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  56.82 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  56.62 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  56.75 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  62.3 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  44.18 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  38.17 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  37.72 
 
 		 450 aa  306  6e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  42.79 
 
 		 437 aa  296  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  42.73 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  36.48 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  40.09 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  34.57 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  33.85 
 
 		 449 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  34.08 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  32.68 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  36.36 
 
 		 491 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  36.48 
 
 		 502 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  34.83 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  37.1 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  35.31 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  28.33 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  28.33 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  28.05 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  29.41 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  26.35 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  26.12 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  26.13 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26.13 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  26.13 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  24.02 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  26.54 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  27.56 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>