196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0213 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  100 
 
 		 108 aa  226  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  50.51 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  45.28 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  45.28 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  45.71 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  46.15 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  48 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  46.46 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  43.81 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  45.71 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  45.71 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  45.28 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  45.71 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  44.95 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  40.57 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  40.95 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  46.46 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  41.51 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  40.95 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  45.54 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  40.95 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  45.54 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  46 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  40 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  40 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  45.54 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  40 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  40 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  38.68 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  40.57 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  42.57 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  42.42 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  42.42 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  44.76 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  46.53 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  41.51 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  43.43 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  43.14 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  44.9 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  44 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  38.38 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  41.75 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  41 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  41.58 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  41.58 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  40.59 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  36.54 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  39.6 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  37.37 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  36 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  44 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  36.36 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  36.36 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  37.5 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  36.73 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.58 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  38 
 
 		 595 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  39.42 
 
 		 597 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  40.62 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.35 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.63 
 
 		 597 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  40.62 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  39.8 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  35.35 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  36.36 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  34.31 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  35.71 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.56 
 
 		 410 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  32.04 
 
 		 217 aa  66.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  30 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  34.74 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 		 598 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  35.4 
 
 		 343 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 		 597 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.41 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  32.67 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 597 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  37.35 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 596 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  27.66 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  40 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.99 
 
 		 410 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  33.33 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  33.33 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  34.69 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  37.35 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 		 572 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  34.94 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  32.61 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  36.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  32.32 
 
 		 624 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  37.21 
 
 		 592 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  34.48 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  38.55 
 
 		 594 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  30.3 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0361  ferredoxin, 2Fe-2S  34.48 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  29.7 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>