44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3811 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3811  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0118  hypothetical protein  61.63 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.000656824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0067  putative thioredoxin-like protein  55.56 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2987  thioredoxin domain-containing protein  48.24 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.629389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0067  hypothetical protein  48.98 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.667095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1834  hypothetical protein  54.12 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3067  thioredoxin domain-containing protein  51.65 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3184  thioredoxin domain-containing protein  51.65 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3682  Thioredoxin domain  52.33 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6480  hypothetical protein  53.01 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.737381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3568  hypothetical protein  52.27 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3129  thioredoxin domain-containing protein  53.01 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2515  thioredoxin domain-containing protein  53.01 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3126  thioredoxin domain-containing protein  52.33 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3145  thioredoxin domain-containing protein  53.01 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372675  normal  0.90267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3359  Thioredoxin domain protein  49.43 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.122401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2768  hypothetical protein  41.28 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4418  putative thioredoxin protein  49.4 
 
 		 125 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0147  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1672  Thioredoxin domain protein  51.46 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2349  hypothetical protein  48.89 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0156  hypothetical protein  48.89 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2272  hypothetical protein  48.89 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.888123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0140  hypothetical protein  48.89 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2809  hypothetical protein  48.89 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0344  putative thioredoxin  48.89 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0126  hypothetical protein  51.22 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3386  hypothetical protein  48.84 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  0.1634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0307  Thioredoxin domain  46.15 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0033  thioredoxin domain-containing protein  49.4 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3411  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2659  hypothetical protein  45.69 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0481247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2564  hypothetical protein  45.19 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0961873  hitchhiker  0.00714519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1244  hypothetical protein  46.39 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1791  Thioredoxin domain protein  41.86 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  35.09 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1222  thioredoxin-related  32.93 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0192497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  35.09 
 
 		 120 aa  43.9  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  29.23 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  29.31 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  25.86 
 
 		 148 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>