57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3038 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1053    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  31.4 
 
 		 660 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  28.99 
 
 		 585 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  24.1 
 
 		 512 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  28.7 
 
 		 522 aa  87.8  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  30.23 
 
 		 596 aa  87.4  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  26.28 
 
 		 1117 aa  86.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  28.77 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  29.26 
 
 		 724 aa  85.1  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  28.37 
 
 		 569 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  27.23 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  26.89 
 
 		 521 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  30.77 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  26.42 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  27.38 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  26.39 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  28.64 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  28.7 
 
 		 585 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  27.23 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  26.07 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  26.48 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  24.66 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  27.42 
 
 		 697 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  31.73 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  29.91 
 
 		 686 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  31.05 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  23.19 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  33.68 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  32.65 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  27.35 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  26.63 
 
 		 690 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.63 
 
 		 700 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  32.31 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  29.1 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  26.43 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  26.98 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  30.97 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  33.67 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  31.82 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  26.32 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  32.65 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  25.65 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  25.97 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  25.33 
 
 		 542 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  27.27 
 
 		 405 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  26.02 
 
 		 497 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  25.79 
 
 		 499 aa  53.9  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  25.79 
 
 		 499 aa  53.9  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  31.78 
 
 		 522 aa  53.9  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  24.72 
 
 		 802 aa  53.9  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  33 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  25.42 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  30.84 
 
 		 517 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  22.12 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  24.2 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  24.2 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1880  hypothetical protein  29.38 
 
 		 535 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>