75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2692 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1018  methylmalonyl-CoA epimerase  84.11 
 
 		 154 aa  267  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2516  lactoylglutathione lyase  79.61 
 
 		 155 aa  261  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1854  lactoylglutathione lyase  77.12 
 
 		 153 aa  259  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0300  lactoylglutathione lyase  78.29 
 
 		 158 aa  258  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00424343  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2044  lactoylglutathione lyase  76.47 
 
 		 153 aa  258  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0914  lactoylglutathione lyase  77.48 
 
 		 155 aa  255  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0928  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.48 
 
 		 155 aa  256  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2378  lactoylglutathione lyase  76.32 
 
 		 162 aa  254  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3777  lactoylglutathione lyase  76.16 
 
 		 156 aa  254  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.34023  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2168  lactoylglutathione lyase  74.51 
 
 		 156 aa  253  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71915  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1139  lactoylglutathione lyase  78 
 
 		 158 aa  250  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0160396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2133  lactoylglutathione lyase  76.67 
 
 		 163 aa  250  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2801  lactoylglutathione lyase  74.17 
 
 		 169 aa  246  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3408  lactoylglutathione lyase  72.37 
 
 		 155 aa  245  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68 
 
 		 158 aa  220  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46728  predicted protein  63.33 
 
 		 186 aa  203  7e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  35.96 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.39 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  26.9 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  29.37 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  29.5 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.89 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  26.9 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  26.85 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  28.78 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  26.02 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  28.78 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.17 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.13 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  28.08 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.48 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  28.08 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1989  methylmalonyl-CoA epimerase  27.34 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  25.9 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  26.17 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  27.4 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  30.23 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  27.46 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  27.66 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  26.76 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  25.35 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0555  methylmalonyl-CoA epimerase  26.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  34.92 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  31.03 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  28.47 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  26.97 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 		 128 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.6 
 
 		 129 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  26.83 
 
 		 134 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  24.65 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.18 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.03 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  25.87 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  34.92 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  25.23 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  38.1 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  22.95 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.71 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  29.47 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  26.09 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  28.43 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  27.05 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  24.59 
 
 		 141 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>