58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2336 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2335  hypothetical protein  69.92 
 
 		 531 aa  748    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2334  hypothetical protein  70.24 
 
 		 523 aa  737    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2330  hypothetical protein  71.67 
 
 		 521 aa  718    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1079    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2337  hypothetical protein  84.98 
 
 		 525 aa  903    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27670  hypothetical protein  68.83 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1317  protein of unknown function DUF1703  47.99 
 
 		 514 aa  501  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00550459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1580  protein of unknown function DUF1703  47.23 
 
 		 509 aa  490  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0027  protein of unknown function DUF1703  45.47 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0206  protein of unknown function DUF1703  46.64 
 
 		 507 aa  472  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1548  protein of unknown function DUF1703  45.91 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0957  protein of unknown function DUF1703  46.59 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3150  hypothetical protein  45.65 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0480  hypothetical protein  47.01 
 
 		 519 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.968392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3165  hypothetical protein  45.09 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0724  hypothetical protein  44.7 
 
 		 522 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1111  hypothetical protein  45.25 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0014  hypothetical protein  45.4 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0068  hypothetical protein  45.75 
 
 		 515 aa  445  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1564  protein of unknown function DUF1703  44.49 
 
 		 505 aa  435  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0366529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1965  hypothetical protein  46.44 
 
 		 521 aa  438  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1351  hypothetical protein  45.11 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00559993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0650  hypothetical protein  44.98 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.232335  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1193  hypothetical protein  45.17 
 
 		 522 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1428  hypothetical protein  43.64 
 
 		 521 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0225206  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1241  hypothetical protein  42.77 
 
 		 519 aa  425  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0535  hypothetical protein  43.33 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1671  hypothetical protein  42.88 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1080  hypothetical protein  41.62 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0178901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1046  hypothetical protein  41.6 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1021  hypothetical protein  41.94 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1024  hypothetical protein  42.66 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0755  hypothetical protein  41.78 
 
 		 505 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1025  hypothetical protein  42.36 
 
 		 505 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0760  protein of unknown function DUF1703  43.71 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1721  hypothetical protein  43 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0520  hypothetical protein  33.84 
 
 		 517 aa  318  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00756457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0467  hypothetical protein  33.21 
 
 		 514 aa  318  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0519  hypothetical protein  33.46 
 
 		 514 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.10766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1056  hypothetical protein  32.45 
 
 		 516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000468377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6663  protein of unknown function DUF1703  35.37 
 
 		 510 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0406  hypothetical protein  34.44 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.220089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2519  hypothetical protein  34.09 
 
 		 536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.064886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3806  protein of unknown function DUF1703  65.56 
 
 		 158 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1121  hypothetical protein  25.83 
 
 		 567 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1851  hypothetical protein  25.05 
 
 		 572 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1429  hypothetical protein  26.26 
 
 		 565 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.792098  normal  0.108789 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0962  protein of unknown function DUF1703  56.41 
 
 		 78 aa  93.2  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000751182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0419  hypothetical protein  30.23 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1886  hypothetical protein  24.68 
 
 		 580 aa  90.9  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2289  hypothetical protein  26.92 
 
 		 564 aa  90.1  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2290  hypothetical protein  26.62 
 
 		 566 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1801  AAA-ATPase-like protein  27.45 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0677168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0410  hypothetical protein  27.53 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.414748  normal  0.0533426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3163  hypothetical protein  27.56 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1302  hypothetical protein  65.96 
 
 		 115 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.258408  normal  0.0413465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2723  hypothetical protein  31.62 
 
 		 158 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000012613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0364  hypothetical protein  53.19 
 
 		 48 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.271227  normal  0.0738724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>