More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1947 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1947  maf protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  67.17 
 
 		 200 aa  275  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  64.85 
 
 		 202 aa  258  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  60.61 
 
 		 200 aa  224  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2689  maf protein  66.5 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  65.66 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  64.65 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  62.87 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1343  Maf-like protein  63.05 
 
 		 204 aa  214  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  60.41 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  60.7 
 
 		 204 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  59.9 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  63.21 
 
 		 228 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  62.18 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  58.67 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  64.1 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  61.34 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  63.1 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  61.46 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  61.46 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  61.46 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  60.82 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  61.5 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  55 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1890  Maf-like protein  60.1 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1378  Maf-like protein  60.1 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1234  Maf-like protein  60.1 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0352  Maf-like protein  60.1 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0798  Maf-like protein  60.1 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1069  Maf-like protein  60.1 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1225  Maf-like protein  60.1 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  57.64 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  56.85 
 
 		 208 aa  191  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  55.21 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1009  Maf-like protein  59.79 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2070  Maf-like protein  58.25 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680146  normal  0.298282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  50.51 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  43.15 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  48.7 
 
 		 202 aa  157  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  43.69 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  49.22 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  46.11 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  47.96 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  47.18 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  47.15 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  46.63 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  45.41 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  47.15 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  44.16 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  45.05 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  45.36 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  44.79 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  47.15 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  44.85 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  42.13 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  45.5 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  48.19 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01886  Maf-like protein  52.6 
 
 		 171 aa  140  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  42.71 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  44.56 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  42.35 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  38.02 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  45.05 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  45.05 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  42.27 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  42.27 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  42.27 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  41.38 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  43.28 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  45.08 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  43.65 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  41.75 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  45.64 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  41.75 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  44.95 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  41.97 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  41.27 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  40.1 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  44.12 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  40.31 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  47.67 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  43.35 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  42.19 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  43.27 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  41.45 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  46.63 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  42.65 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  40.41 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  40.41 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  41.38 
 
 		 194 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  42.93 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  43.43 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  42.86 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  42.93 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  39.9 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  42.65 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  42.93 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  42.31 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  43.65 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  39.9 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>