More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0706 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  78.69 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  63.82 
 
 		 300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  63.49 
 
 		 300 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  63.49 
 
 		 300 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  61.11 
 
 		 304 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  59.08 
 
 		 301 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  58.22 
 
 		 299 aa  363  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  57.89 
 
 		 305 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  57.65 
 
 		 304 aa  361  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  56.68 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  48.18 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  48.84 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  45.51 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  45.7 
 
 		 304 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  45.42 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  44.19 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  42.72 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  40.85 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  33.89 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  30.61 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  34.84 
 
 		 253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.53 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 		 238 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  31.89 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  35.74 
 
 		 425 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  32.38 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.16 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.78 
 
 		 394 aa  102  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  33.2 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  35.92 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  32.05 
 
 		 538 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  31.74 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  35.93 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.43 
 
 		 564 aa  98.2  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  32.91 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 		 477 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  34.48 
 
 		 548 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  33.96 
 
 		 554 aa  96.3  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.85 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  35 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  27.67 
 
 		 263 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32.34 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 		 597 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 		 276 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.04 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  35.5 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  31.62 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  32.77 
 
 		 445 aa  93.2  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.58 
 
 		 252 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.06 
 
 		 247 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  29.67 
 
 		 250 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  32.88 
 
 		 252 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  35.16 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.89 
 
 		 438 aa  92.4  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  36.12 
 
 		 467 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.09 
 
 		 470 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.51 
 
 		 507 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  29.27 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.65 
 
 		 611 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  35.62 
 
 		 469 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  33.64 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  29.67 
 
 		 250 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.47 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.24 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  28.92 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  31.98 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  28.05 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  33.61 
 
 		 449 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.2 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  34.91 
 
 		 395 aa  90.5  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  35 
 
 		 452 aa  90.9  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  31.95 
 
 		 633 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  31.56 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 		 240 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  34.18 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  33.64 
 
 		 421 aa  89.7  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  34.19 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  36.05 
 
 		 474 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  31.17 
 
 		 256 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  37.91 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  34.91 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  34.11 
 
 		 248 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3377  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.44 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  decreased coverage  0.000190806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>