36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1725 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1725  hypothetical protein  100 
 
 
1993 aa  4001    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.48 
 
 
2449 aa  352  5e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0045  adhesion exoprotein  34.86 
 
 
3692 aa  294  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0143  adhesion exoprotein  27.41 
 
 
2823 aa  172  7e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0046  adhesion exoprotein  27.9 
 
 
985 aa  130  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1655  hypothetical protein  24.94 
 
 
1425 aa  107  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0576  hypothetical protein  33.33 
 
 
996 aa  103  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0410  adhesion exoprotein  23.54 
 
 
2457 aa  101  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  26.67 
 
 
979 aa  91.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10770  MucBP-like protein  32.62 
 
 
721 aa  90.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.712017  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0044  adhesion exoprotein  26.06 
 
 
873 aa  85.9  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  22.05 
 
 
2833 aa  73.2  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1259  YSIRK Gram-positive signal peptide  37.96 
 
 
328 aa  62.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.076162  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0939  adhesion exoprotein  25.7 
 
 
615 aa  58.9  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000746139  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  31.01 
 
 
3409 aa  57  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  33.33 
 
 
2397 aa  57  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0944  adhesion exoprotein  27.38 
 
 
524 aa  56.2  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00559736  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1258  cell wall anchor domain-containing protein  25.8 
 
 
745 aa  53.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  35.2 
 
 
521 aa  52.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  38.36 
 
 
1172 aa  51.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  31.08 
 
 
3521 aa  51.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  31.51 
 
 
248 aa  49.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9251  hypothetical protein  25.56 
 
 
651 aa  48.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457803  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  30.67 
 
 
3472 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  36.84 
 
 
497 aa  48.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28970  hypothetical protein  35.16 
 
 
419 aa  48.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  30.67 
 
 
3471 aa  48.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0433  surface protein Rib  56.41 
 
 
1389 aa  48.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0365  hypothetical protein  33.02 
 
 
553 aa  48.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  30.77 
 
 
2327 aa  47  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  39.34 
 
 
606 aa  47  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5097  hypothetical protein  34.41 
 
 
537 aa  47  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00280261  normal  0.375378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0545  hypothetical protein  33.33 
 
 
570 aa  46.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  39.13 
 
 
1594 aa  46.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0563  hypothetical protein  26.67 
 
 
583 aa  45.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  0.259662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0551  hypothetical protein  26.67 
 
 
583 aa  45.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>