More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1401 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  100 
 
 
121 aa  243  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  39.29 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  39.82 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  44.23 
 
 
117 aa  95.9  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  35.71 
 
 
120 aa  93.6  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  37.96 
 
 
118 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  37.07 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  38.39 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1233  iojap-like protein  48.15 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000702287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  37.5 
 
 
115 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  38.78 
 
 
112 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  38.74 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  34.78 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  37.25 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  36.04 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  35.19 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  39.42 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  35.51 
 
 
141 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  35.45 
 
 
120 aa  87  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  36.36 
 
 
118 aa  87  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  35.14 
 
 
148 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0234  hypothetical protein  39.47 
 
 
119 aa  86.7  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  35.92 
 
 
168 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  36.19 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  34.51 
 
 
122 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  33.63 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  37.76 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  41.28 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  34.82 
 
 
210 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  36.61 
 
 
163 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  37.14 
 
 
105 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  35.24 
 
 
115 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  35.51 
 
 
113 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  37.07 
 
 
150 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4450  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2299  iojap-like protein  38.82 
 
 
91 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000554928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  38.61 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  33.64 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000071595  hitchhiker  0.00000138621 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  37.04 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  34.26 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  31.86 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  34.26 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  40.37 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000680321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  35.45 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  37.89 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  37.89 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  34 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  36.27 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  36.04 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  34.82 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  42.59 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4411  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0836383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4228  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4066  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.08408e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4076  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000293892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4556  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  33.64 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  39.58 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  34.31 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  34 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4463  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  36.54 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  33.98 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  35.24 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  32.73 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  33.33 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.176086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  31.48 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  39.36 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  36.73 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  31.63 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  43.53 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  33.63 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  31.86 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  34.62 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  34.65 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08901  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  36.11 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  31.63 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0224  Iojap-related protein  37.04 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.739057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  33.33 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  34.44 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  33.33 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  33.33 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  35.24 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>