238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0320 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  100 
 
 
267 aa  528  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  53.47 
 
 
264 aa  254  8e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  50.41 
 
 
267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  51.02 
 
 
267 aa  249  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  47.15 
 
 
266 aa  247  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  51.43 
 
 
266 aa  244  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  51.02 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  51.02 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  51.02 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  51.02 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  51.02 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  50.57 
 
 
264 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  50.61 
 
 
264 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  50.61 
 
 
264 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  50.61 
 
 
264 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  51.43 
 
 
264 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  50.61 
 
 
264 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  49.8 
 
 
264 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  42.38 
 
 
268 aa  231  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 
268 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  45.68 
 
 
267 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  48.16 
 
 
265 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  43.97 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  46.31 
 
 
265 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  45.87 
 
 
270 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  41.74 
 
 
269 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  40.98 
 
 
268 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  40.98 
 
 
268 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  42.86 
 
 
268 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  42.04 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  42.04 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  42.91 
 
 
268 aa  199  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  44.02 
 
 
255 aa  198  7e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  43.51 
 
 
262 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  38.13 
 
 
269 aa  192  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  39.04 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  37.08 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  36.99 
 
 
262 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  38.93 
 
 
269 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  39.08 
 
 
265 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  37.3 
 
 
259 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  36.06 
 
 
265 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  39.17 
 
 
264 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  37.96 
 
 
269 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  36.33 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  35.43 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  33.06 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  34.8 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  34.35 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  34.32 
 
 
810 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  42.58 
 
 
438 aa  142  5e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  33.74 
 
 
246 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 
336 aa  138  7e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  30.58 
 
 
332 aa  137  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  34.58 
 
 
244 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  33.47 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  35.86 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.88 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  33.59 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 
770 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.27 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  31.3 
 
 
284 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  30.71 
 
 
255 aa  99  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  32.17 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  27.69 
 
 
259 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  29.22 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  27.4 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  25.68 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  24.07 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.42 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  30.85 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  29 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  27.44 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  29.39 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  28.57 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.23 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  31.76 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  30 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  23.87 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  26.81 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.65 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  26.64 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  25.87 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  30 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.35 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  26.17 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1913  ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.37 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  23.9 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0652  cobalt transport protein  34.15 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3119  ABC transporter permease  31.86 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3365  ABC transporter permease  31.86 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  21.51 
 
 
200 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3338  ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  21.51 
 
 
200 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  30.95 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  21.51 
 
 
200 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>