More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t0021 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0753  tRNA-Met  98.63 
 
 		 74 bp  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0540995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.390156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0081  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.681899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0054  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.965262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0068  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.347514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0076  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00786304  normal  0.218816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0007  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  95.31 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  95.31 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  95.31 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  95.24 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0019  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6011  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.991195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0021    91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.24709  hitchhiker  0.00028661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA11  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0046  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0046  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0056  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0027  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0057  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0045  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0026  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0008  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100905  hitchhiker  0.00491713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0383  tRNA-Met  93.75 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0058  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0057  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0074  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>