120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2155 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2155  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  763    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1866  hypothetical protein  35.75 
 
 
399 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.908975  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  27.56 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  25.52 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0997  hypothetical protein  26.7 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.728779  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  26.67 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  26.93 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  26.93 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  26.93 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  26.65 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  26.67 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1055  hypothetical protein  26.7 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  26.46 
 
 
423 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2834  hypothetical protein  27.69 
 
 
410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1058  protein of unknown function DUF1006  26.7 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  26.63 
 
 
416 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  25.47 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  23.75 
 
 
388 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  28.16 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  26.27 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  25.8 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  27.3 
 
 
388 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  27.3 
 
 
388 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  27.01 
 
 
388 aa  117  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  26.01 
 
 
403 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  26.01 
 
 
403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  26.01 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  26.47 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  26.25 
 
 
397 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  27.35 
 
 
402 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  26.01 
 
 
403 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  24.93 
 
 
402 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  23.69 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  27.51 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  25.9 
 
 
390 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  25.9 
 
 
389 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  26.6 
 
 
406 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  25.62 
 
 
390 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  24.54 
 
 
410 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  24.54 
 
 
410 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  24.54 
 
 
410 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  25.9 
 
 
390 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  24.03 
 
 
406 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  24.87 
 
 
409 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3685  hypothetical protein  27.09 
 
 
371 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  24.15 
 
 
396 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  25.81 
 
 
397 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  25.13 
 
 
405 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  24.8 
 
 
411 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  25.35 
 
 
466 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  26.21 
 
 
392 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  24.6 
 
 
410 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  24.87 
 
 
403 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  25.74 
 
 
403 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  27.23 
 
 
398 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  26.01 
 
 
403 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  23.48 
 
 
410 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  23.81 
 
 
410 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  24.53 
 
 
401 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  25.4 
 
 
406 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  23.16 
 
 
410 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  23.16 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  23.16 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  23.16 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  23.16 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  23.16 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  23.16 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  24.2 
 
 
401 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  23.16 
 
 
410 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  22.89 
 
 
410 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  25.7 
 
 
441 aa  96.3  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  24.87 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  23.42 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  23.87 
 
 
399 aa  92.8  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  23.53 
 
 
394 aa  89.4  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  24.14 
 
 
404 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  24.18 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  23.94 
 
 
450 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  22.8 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  22.56 
 
 
442 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  24.35 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  23.74 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  23.74 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  24.8 
 
 
389 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  23.04 
 
 
380 aa  85.9  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  23.94 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  23.92 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  23.53 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  23.18 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  22.36 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  22.55 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  23.35 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  21.19 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2127  hypothetical protein  24.78 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187973  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  22.16 
 
 
437 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1855  protein of unknown function DUF1006  23.84 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  21.28 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1661  hypothetical protein  21.91 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.874726  normal  0.124074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  23.54 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2326  protein of unknown function DUF1006  26.48 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.193329  hitchhiker  0.00000627323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>