More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  698    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  63.1 
 
 		 354 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  60.67 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  67.43 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  64.53 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  62.61 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  61.62 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  62.02 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 367 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  61.21 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  64.12 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  59.14 
 
 		 350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  64.35 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  64.08 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  61.32 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  61.8 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  61.8 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  59.13 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  56.32 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  64.35 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  57.43 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  59.57 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  65.6 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  60.57 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  65.07 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  62.46 
 
 		 378 aa  345  8e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.48 
 
 		 356 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 372 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  48.27 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49.18 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  46.11 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  47.08 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  47.84 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  47.84 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 355 aa  322  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  45.56 
 
 		 356 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  45.9 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  45.06 
 
 		 356 aa  318  7.999999999999999e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 360 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 360 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 360 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  48.48 
 
 		 363 aa  318  9e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  44.8 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  46.97 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 359 aa  316  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  44.63 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  46.91 
 
 		 370 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  43.91 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  43.98 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  42.21 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  42.21 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  43.18 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  41.94 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  43.85 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  42.7 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  44.77 
 
 		 362 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 355 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  45.77 
 
 		 362 aa  305  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  43.02 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  43.02 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  46.49 
 
 		 363 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  48.01 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  46.86 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>