48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  45.54 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  45 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  43 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  40.62 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.68 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  38.54 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  40.34 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  38.1 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  38.1 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  44.44 
 
 		 524 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.36 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.3 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.7 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  41.67 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  38.68 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  39.81 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  54 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  35.35 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  35.92 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  32 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  35.56 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  31.4 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12855  hypothetical protein  35.92 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.42 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  33.72 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  25.58 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  25.51 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  33.96 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  34.69 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  41.67 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  36.78 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  32.14 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  37.93 
 
 		 104 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  34.12 
 
 		 93 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  29.36 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  33.72 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  34.48 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  23.71 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  28.83 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  31.48 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  25.49 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  22.45 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  30.59 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>