20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4649 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  100 
 
 
176 aa  338  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  39.72 
 
 
155 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  36.36 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  40.29 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  37.78 
 
 
137 aa  60.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  44 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  48.51 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  36.76 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  43.56 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  42.31 
 
 
144 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  46.67 
 
 
160 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  33.33 
 
 
126 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  35.33 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1311  hypothetical protein  35.77 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  34.31 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  34.87 
 
 
186 aa  44.3  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  26.47 
 
 
129 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  35.38 
 
 
170 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  27.14 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3129  TadE family protein  38.78 
 
 
140 aa  41.2  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>