More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1268 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.35 
 
 
550 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2124  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.12 
 
 
547 aa  768    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00337947  hitchhiker  0.00781719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  72.53 
 
 
546 aa  805    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.15 
 
 
550 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4138  ATP synthase F1, alpha subunit  71.69 
 
 
545 aa  802    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.49 
 
 
548 aa  788    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1919  ATP synthase F1, alpha subunit  67.46 
 
 
542 aa  751    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.086846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.16 
 
 
547 aa  815    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 
553 aa  763    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  69.23 
 
 
545 aa  760    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.38 
 
 
548 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.51 
 
 
549 aa  828    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  75.69 
 
 
543 aa  823    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1125  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.74 
 
 
543 aa  791    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.826073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.81 
 
 
541 aa  841    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.65 
 
 
548 aa  768    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.34 
 
 
552 aa  760    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0146  ATP synthase F1, alpha subunit  69.8 
 
 
553 aa  780    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.445327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  72.27 
 
 
549 aa  805    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4330  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.93 
 
 
548 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930948  normal  0.0279627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2340  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.77 
 
 
545 aa  837    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1268  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
552 aa  1118    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.79 
 
 
544 aa  819    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.59 
 
 
549 aa  763    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.38 
 
 
548 aa  763    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3918  ATP synthase F1, alpha subunit  74.81 
 
 
546 aa  832    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  75.55 
 
 
543 aa  828    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  74.77 
 
 
542 aa  825    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1253  ATP synthase F1, alpha subunit  66.3 
 
 
544 aa  734    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0274043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  75.19 
 
 
549 aa  836    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.73 
 
 
544 aa  832    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2607  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.14 
 
 
545 aa  838    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197618  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1776  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.45 
 
 
543 aa  832    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.984214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.12 
 
 
554 aa  825    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6138  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.99 
 
 
548 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.16 
 
 
555 aa  821    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1761  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.49 
 
 
547 aa  837    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.38 
 
 
548 aa  763    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  60.51 
 
 
504 aa  622  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.5 
 
 
505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.7 
 
 
505 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  57.76 
 
 
502 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.34 
 
 
509 aa  598  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  58.55 
 
 
508 aa  597  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.15 
 
 
502 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  58.71 
 
 
508 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.5 
 
 
505 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.37 
 
 
502 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.76 
 
 
502 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.86 
 
 
501 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.91 
 
 
505 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.14 
 
 
505 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  56.95 
 
 
541 aa  592  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.76 
 
 
502 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  593  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.29 
 
 
507 aa  590  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.91 
 
 
504 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.53 
 
 
509 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.53 
 
 
509 aa  591  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.76 
 
 
502 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  57.84 
 
 
501 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.88 
 
 
505 aa  590  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.83 
 
 
502 aa  590  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  57.37 
 
 
501 aa  588  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.46 
 
 
526 aa  588  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.51 
 
 
505 aa  586  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  57.34 
 
 
507 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  59.3 
 
 
501 aa  586  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.91 
 
 
504 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.53 
 
 
505 aa  587  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.23 
 
 
509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.36 
 
 
506 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  54.62 
 
 
512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.71 
 
 
507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.29 
 
 
503 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.52 
 
 
504 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.29 
 
 
503 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.15 
 
 
505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.77 
 
 
505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  58.81 
 
 
503 aa  579  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.06 
 
 
503 aa  581  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.25 
 
 
502 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  57.97 
 
 
509 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.25 
 
 
502 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.08 
 
 
505 aa  580  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.47 
 
 
520 aa  578  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.9 
 
 
506 aa  578  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.99 
 
 
526 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.13 
 
 
501 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.71 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.56 
 
 
510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.98 
 
 
526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.37 
 
 
503 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>