154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1970 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 67 aa  137  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  71.93 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  70.18 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  69.64 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  71.93 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  63.64 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  62.5 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  66.07 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  62.12 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  64.91 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  64.91 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  64.91 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  62.5 
 
 		 142 aa  85.9  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  64.91 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  60.94 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  57.81 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  65.45 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  61.9 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  58.21 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  56.06 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  56.06 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  64.91 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  53.03 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  64.29 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  55.38 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  59.65 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  61.4 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  63.16 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  54.55 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  52.24 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  56.06 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  54.55 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  60 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  59.32 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  48.48 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  56.14 
 
 		 58 aa  71.2  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  53.45 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  47.76 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  52.17 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  51.79 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  54.72 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  50.82 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  44.62 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  49.12 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  47.83 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  49.12 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  53.97 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0104  hypothetical protein  43.55 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  45.61 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  47.83 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  43.86 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  43.86 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  41.18 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  41.79 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  45.61 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  44.78 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  49.12 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  46.97 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  49.18 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  47.17 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  45.61 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  45.61 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  47.37 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  46.55 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  43.86 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  45.61 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  41.82 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  47.37 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  46.43 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  45.61 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  43.4 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  41.79 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  44.26 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  45.61 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  45.61 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  45.61 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  41.79 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  43.86 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  43.86 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  41.79 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  41.79 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  41.79 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  41.79 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  43.86 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  43.86 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  44.83 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  43.86 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2468  hypothetical protein  38.81 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0737911 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  42.11 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  43.86 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  43.86 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>