29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1552 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  100 
 
 		 299 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  40.46 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  36.18 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  38.43 
 
 		 452 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  33.08 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  33.08 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  30.98 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  32.43 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  31.74 
 
 		 335 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  34.2 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  33.06 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  32.6 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  29.62 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  33.88 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  32.16 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  33.48 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  31.48 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  27.78 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  28.17 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  23.05 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  30.37 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  28.85 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  29.9 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  55.17 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  25.3 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03900  eukaryotic initiation factor 4F subunit P130, putative  38.27 
 
 		 1494 aa  46.2  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  24.48 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  25.55 
 
 		 514 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  27.72 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>