46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3888 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  46.46 
 
 		 202 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  46.46 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.47 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46 
 
 		 202 aa  167  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  42.71 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  49.24 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  49.24 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.86 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.36 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.71 
 
 		 201 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.61 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.73 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  48.73 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.73 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  48.73 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  48.73 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  43.72 
 
 		 203 aa  154  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  48.73 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.71 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.85 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.97 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.85 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.9 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.69 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.08 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  45.18 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.52 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.51 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.3 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.16 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.02 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  29.86 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  29.86 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1345  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  39.77 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.34 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.71 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  36.89 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.73 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1132  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 242 aa  42  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  40.24 
 
 		 207 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0608  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1257  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 242 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.18 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>