More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0529 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  65.7 
 
 		 207 aa  287  8e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  61.65 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  52.83 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  50.46 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  49 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  47.26 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  42.79 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  44.06 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  41.55 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  42.05 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  39.15 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  39.51 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  31.84 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  29.91 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  29.38 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  29.3 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  35.15 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  25.46 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  28.84 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  37.04 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  33.82 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  36.28 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  41.77 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  33.51 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  33.66 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  32.97 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.59 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.1 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.65 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.65 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.15 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.65 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 295 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03936  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.24 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165718  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  48.15 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  48.15 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.71 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  38.1 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  41.54 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  42.5 
 
 		 414 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  40.48 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  33.68 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.36 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.36 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  52.08 
 
 		 389 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  52.08 
 
 		 389 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  30.84 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  40.28 
 
 		 364 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.3 
 
 		 296 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.35 
 
 		 296 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  29.07 
 
 		 262 aa  52  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.54 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.54 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  50.94 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.54 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.92 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03117  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.491501  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.92 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3697  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.61 
 
 		 506 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.54 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03068  hypothetical protein  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1487  ribosomal L11 methyltransferase  39.24 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000855878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4576  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000190936  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3451  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000753069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3554  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000257294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  40.22 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.92 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.19 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.7 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3642  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000842217  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0565  putative methyltransferase  30.19 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000647034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0137973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.32 
 
 		 290 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3681  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.79 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.463059  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3646  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  decreased coverage  0.000138763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.54 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3574  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00265065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3575  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 360 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.54 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>