41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2630 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2630  UspA domain protein  100 
 
 
298 aa  574  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4122  UspA domain protein  59.45 
 
 
291 aa  325  8.000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3730  UspA domain protein  35.09 
 
 
293 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  36.84 
 
 
319 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 
792 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  23.94 
 
 
859 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.74 
 
 
863 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  31.73 
 
 
625 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  23.76 
 
 
875 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  24.91 
 
 
879 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  24.91 
 
 
879 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  25.26 
 
 
862 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 
820 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
764 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  22.26 
 
 
692 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
745 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 
770 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  25.35 
 
 
897 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  23.04 
 
 
863 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 
786 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  27.41 
 
 
732 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  21.4 
 
 
698 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  21.4 
 
 
698 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
152 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.57 
 
 
152 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  26.02 
 
 
604 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
750 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  27.42 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.1 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  22.56 
 
 
715 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  22.56 
 
 
715 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  28.93 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>