31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2269 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  100 
 
 
177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  92.09 
 
 
177 aa  331  3e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  79.66 
 
 
177 aa  298  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  74.58 
 
 
177 aa  270  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  75.71 
 
 
177 aa  269  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  71.19 
 
 
177 aa  259  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  60.12 
 
 
173 aa  218  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  49.71 
 
 
291 aa  181  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  48 
 
 
291 aa  178  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  47.9 
 
 
288 aa  167  9e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  45.93 
 
 
293 aa  167  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  47.09 
 
 
292 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  45.35 
 
 
292 aa  157  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  44.19 
 
 
292 aa  153  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  44.19 
 
 
303 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  42.59 
 
 
302 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  43.71 
 
 
292 aa  145  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  43.02 
 
 
303 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  42.44 
 
 
303 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  41.86 
 
 
303 aa  141  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  39.18 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  42.35 
 
 
178 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  36.26 
 
 
194 aa  120  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  34.48 
 
 
300 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  35.06 
 
 
300 aa  104  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  32.93 
 
 
295 aa  91.3  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  31.48 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  31.79 
 
 
286 aa  61.6  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  34.29 
 
 
286 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  30 
 
 
286 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  28.1 
 
 
286 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>