More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0170 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
452 aa  867    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1586  major facilitator transporter  51.06 
 
 
448 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0030166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2556  major facilitator family transporter  49.4 
 
 
430 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2259  nitrite extrusion protein, putative  49.4 
 
 
430 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0505  major facilitator transporter  48.28 
 
 
437 aa  297  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0881  major facilitator transporter  39.16 
 
 
417 aa  232  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1747  major facilitator transporter  40.49 
 
 
449 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  30.75 
 
 
895 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  30.77 
 
 
912 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  29.75 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
443 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  28.57 
 
 
426 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  30.25 
 
 
905 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  30.7 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  28.19 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  30.18 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  26.7 
 
 
440 aa  126  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  31.1 
 
 
459 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
413 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.01 
 
 
428 aa  123  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
444 aa  123  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  32.7 
 
 
401 aa  123  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
435 aa  123  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  31 
 
 
917 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  30.27 
 
 
453 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  28.6 
 
 
426 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  26.88 
 
 
436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  28.42 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  25 
 
 
389 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  24.88 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  24.88 
 
 
389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  24.88 
 
 
389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  24.94 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  24.88 
 
 
389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  24.88 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  24.88 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  28.67 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.67 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  24.65 
 
 
389 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  27.14 
 
 
420 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
417 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  27.39 
 
 
424 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  26.38 
 
 
431 aa  113  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  29.64 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  29.88 
 
 
404 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.71 
 
 
426 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  27.43 
 
 
422 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.71 
 
 
426 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.71 
 
 
426 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  25.12 
 
 
389 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  31.45 
 
 
403 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.71 
 
 
426 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  27.71 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.15 
 
 
431 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  25.25 
 
 
418 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  29.27 
 
 
893 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
403 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
397 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  26.91 
 
 
422 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  27.92 
 
 
431 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
382 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  30.05 
 
 
411 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  28.92 
 
 
403 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  27.57 
 
 
427 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  27.23 
 
 
472 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  30.23 
 
 
406 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
406 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  28.32 
 
 
439 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  25.51 
 
 
389 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  25.51 
 
 
389 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  29.5 
 
 
403 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
421 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  27.65 
 
 
418 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  23.98 
 
 
424 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  29.7 
 
 
418 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
404 aa  101  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  28.64 
 
 
403 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  27.16 
 
 
406 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  27.16 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  27.16 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
419 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  29.02 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  27.54 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  27.76 
 
 
390 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  28.85 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  28.75 
 
 
414 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  28.94 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  30.37 
 
 
418 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  26.24 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  26.89 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>