32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22890 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_22890  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 380 aa  757    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.11 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  23.17 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  25.1 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22900  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.17 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 724 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.06 
 
 		 734 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 726 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  20.36 
 
 		 742 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.37 
 
 		 743 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  22.9 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.11 
 
 		 704 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 520 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  25.88 
 
 		 234 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  27.4 
 
 		 280 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 315 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2499  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.91 
 
 		 522 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  20.43 
 
 		 388 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 766 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  42 
 
 		 747 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  21.62 
 
 		 742 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23360  O-antigen chain length regulator  40 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000253152  hitchhiker  0.00753817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1969  O-antigen chain length regulator  38.6 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>