More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_21300 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
126 aa  248  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  56.25 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  56.25 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  55.74 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  53.85 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  53.03 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  53.12 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  50.79 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  37.61 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  52.38 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  46.88 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
99 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  37.18 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
659 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  54.17 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
630 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  45.16 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
630 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
298 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
166 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  29 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.58 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
292 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
242 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  41.25 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  41.51 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  40.32 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  34.85 
 
 
246 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
120 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  41.51 
 
 
130 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
299 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
246 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  53.33 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>