203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5909 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
101 aa  197  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.07 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.71 
 
 
75 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.74 
 
 
85 aa  60.1  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.66 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.93 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.29 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1222  Exonuclease VII small subunit  49.28 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1154  Exonuclease VII small subunit  49.28 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.06 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.93 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.89 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1094  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.28 
 
 
93 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0363068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.31 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0851  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.48 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.339936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.21 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.79 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.28 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.44 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.44 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.51 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.76 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.21 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.06 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0155  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.76 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.281027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.59 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.28 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.68 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
83 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0097  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.68 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.26 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.25 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1669  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.33 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000880334  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.92 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.49 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1133  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44078  hitchhiker  0.0045107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.25 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.06 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.24 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.78 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.8 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.57 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.28 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.2 
 
 
87 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.54 
 
 
97 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.29 
 
 
76 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.68 
 
 
155 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.91 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.73 
 
 
84 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 
84 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.28 
 
 
80 aa  50.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.65 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.21 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.47 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.65 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.42 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>