261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5412 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5412  thymidylate synthase  100 
 
 		 262 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  59.09 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  59.09 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  62.88 
 
 		 263 aa  323  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  58.71 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  57.58 
 
 		 264 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  57.58 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  58.71 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  57.2 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  58.56 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  57.04 
 
 		 277 aa  318  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  58.24 
 
 		 285 aa  316  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  59.47 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  58.94 
 
 		 265 aa  315  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  59.47 
 
 		 264 aa  315  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  57.79 
 
 		 267 aa  314  7e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  61.13 
 
 		 264 aa  314  8e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  58.33 
 
 		 264 aa  313  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  58.11 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  59.09 
 
 		 264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  56.06 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  57.95 
 
 		 264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  58.33 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  57.2 
 
 		 264 aa  311  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  58.71 
 
 		 264 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  311  7.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  59.54 
 
 		 270 aa  311  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  58.11 
 
 		 264 aa  311  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  58.33 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  57.99 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  56.44 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  57.95 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  59.7 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  57.58 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  56.44 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  55.3 
 
 		 264 aa  309  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  55.3 
 
 		 264 aa  309  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  57.58 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  55.68 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  57.95 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  57.58 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  58.4 
 
 		 271 aa  308  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  55.3 
 
 		 264 aa  308  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  55.3 
 
 		 264 aa  307  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  57.95 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  54.92 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  57.41 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  55.68 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  56.32 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  58.49 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  56.15 
 
 		 283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  55.96 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2380  thymidylate synthase  59.32 
 
 		 266 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  58.71 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  58.17 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  55.68 
 
 		 280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  58.17 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  58.17 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  53.79 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  54.92 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  55.68 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  55.3 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  54.32 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  56.98 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  57.36 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  57.03 
 
 		 267 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  54.92 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  56.44 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  55.3 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  54.55 
 
 		 264 aa  301  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  55.06 
 
 		 290 aa  301  8.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  56.49 
 
 		 266 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  55.68 
 
 		 264 aa  301  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  56.82 
 
 		 264 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  55.68 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  56.06 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  56.34 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>