25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5246 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  100 
 
 		 708 aa  1420    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  39.18 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  37.35 
 
 		 940 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  37.93 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  32.53 
 
 		 2117 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  40.23 
 
 		 1390 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  38.37 
 
 		 1263 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.73 
 
 		 1095 aa  53.9  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  25.1 
 
 		 470 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  31.58 
 
 		 845 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 		 726 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  30.83 
 
 		 835 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  34.62 
 
 		 2002 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  39.29 
 
 		 792 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2527  TonB family protein  30.17 
 
 		 390 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.700162  normal  0.957554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 		 1222 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1027 aa  47.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  31.87 
 
 		 917 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  40.35 
 
 		 4357 aa  47.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2720  TonB family protein  26.02 
 
 		 419 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  32.69 
 
 		 720 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  36.71 
 
 		 1076 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  32.31 
 
 		 321 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 		 1323 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  25.97 
 
 		 3409 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>