More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4469 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4469  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 429 aa  852    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  53.24 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  52.9 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  53.24 
 
 		 431 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  54.06 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  52.9 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 431 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  52.08 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  55.2 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  54.73 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  54.73 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  54.5 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  52.31 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 		 442 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  48.49 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  53.56 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  48.38 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  51.38 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  48.49 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.92 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  46.62 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 442 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  49.18 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  47.47 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  48.24 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  46.03 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  50.7 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  48.96 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  48.6 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  48.6 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 		 427 aa  405  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  48.6 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  46.03 
 
 		 435 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  48.5 
 
 		 432 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2296  adenylosuccinate synthetase  49.44 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  48.25 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  49.42 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1101  adenylosuccinate synthetase  48.02 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  48.25 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  45.9 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  47.1 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  47.66 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  47.1 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  50.46 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 430 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  49.54 
 
 		 448 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1181  adenylosuccinate synthetase  47.58 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  50.34 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2198  adenylosuccinate synthetase  49.08 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  47.1 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  46.33 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  49.54 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  0.00000299679 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  46.99 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  47.27 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>