24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4252 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  100 
 
 		 866 aa  1752    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  34.39 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  51.95 
 
 		 1188 aa  66.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1316 aa  63.9  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  39.6 
 
 		 14609 aa  62.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  48 
 
 		 1831 aa  62.4  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  37.37 
 
 		 692 aa  60.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 462 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  46.51 
 
 		 1487 aa  58.9  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  37.7 
 
 		 1394 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  40.44 
 
 		 700 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  41.46 
 
 		 767 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 496 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  44.58 
 
 		 3027 aa  52.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  39.6 
 
 		 474 aa  51.6  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  43.06 
 
 		 830 aa  51.2  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.64 
 
 		 3822 aa  51.2  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  35.65 
 
 		 4009 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  38.3 
 
 		 408 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  35.65 
 
 		 4022 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  32.43 
 
 		 1332 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1908 aa  48.5  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  46.38 
 
 		 1107 aa  47.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  32.73 
 
 		 3861 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>