22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1559 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  428  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  35 
 
 		 317 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  30.19 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  28.08 
 
 		 327 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  28.83 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  28.83 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  36.25 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  27.68 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.82 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.48 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  32.5 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  33.75 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  24.32 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  35 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  26.47 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3020  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.43 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  27.03 
 
 		 307 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  25.2 
 
 		 302 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3634  acyl transferase  39.77 
 
 		 305 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0488  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.89 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0963  acyl transferase  39.77 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  25.53 
 
 		 301 aa  41.6  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>