28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0937 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  100 
 
 
356 aa  731    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  29.85 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  23.06 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  25.27 
 
 
353 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  30.81 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  21.01 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  23.99 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  29.27 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  22.38 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  27.73 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  31.82 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  23.26 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  21.21 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  34.62 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  34.62 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  31.71 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  27.34 
 
 
377 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  26.56 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  28.87 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  26.47 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  26.47 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.93 
 
 
353 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  40.35 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.3 
 
 
642 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  46.81 
 
 
533 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  26.83 
 
 
634 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  20.44 
 
 
497 aa  43.5  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  32.86 
 
 
532 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>