40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3365 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  234  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  55.65 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  58.49 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  51.28 
 
 
117 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  59.48 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  48.21 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  55.17 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  41.74 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  49.06 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  49.04 
 
 
131 aa  94  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.52 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  46.36 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  37.39 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  38.26 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  38.94 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  40.7 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  33.93 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  39.42 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  34.82 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  44 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  32.43 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  31.46 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  38.55 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  32.46 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  34.44 
 
 
129 aa  50.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  30.17 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  36.56 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  26.6 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  32.94 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  25.81 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  31.11 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2351  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0391352  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  28.83 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  27.78 
 
 
113 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>