37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2351 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2351  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0391352  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  32.11 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  29.17 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  34.69 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  30.85 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  30.43 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  29.13 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  31.46 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  32.18 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  30.91 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  28 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  35.35 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.4 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  31.4 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  23.81 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  29.9 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  27.08 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  27.12 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  31.76 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  25.56 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  34.55 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  36.21 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  33.78 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  37.29 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  28.75 
 
 
121 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>