62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0046 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0036  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.872291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0011  tRNA-Leu  88.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000743607  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0016  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.454165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 97 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0061  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0027  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0167  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0004  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 67 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1831  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1765  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.393275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  83.87 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2089  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.835616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>