28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0004 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0025  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.637113  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  87.72 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0041  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  83.1 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R25  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0405  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt013  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0080367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02010  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0921241  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0090  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2567  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>