More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2322 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1192    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  68.13 
 
 		 579 aa  799    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 573 aa  811    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  69.7 
 
 		 582 aa  815    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 574 aa  787    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 569 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 561 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 561 aa  395  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 634 aa  350  6e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 561 aa  349  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 555 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 555 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 555 aa  334  3e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 588 aa  322  8e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 569 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 570 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 574 aa  319  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 570 aa  313  4.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 570 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 569 aa  249  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00070  glutamate-tRNA ligase, putative  30.21 
 
 		 728 aa  189  8e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 799 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  29.76 
 
 		 749 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 556 aa  179  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 559 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 552 aa  176  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  27.54 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 556 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 816 aa  174  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 557 aa  174  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  28.68 
 
 		 523 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 555 aa  170  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 554 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 565 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 565 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 580 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 569 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 558 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  27.56 
 
 		 628 aa  165  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 563 aa  165  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 551 aa  163  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 555 aa  163  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 540 aa  163  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 565 aa  163  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 570 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 558 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 552 aa  160  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 560 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 556 aa  160  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  28.26 
 
 		 858 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 555 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 556 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 		 556 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 590 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 582 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 561 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 555 aa  157  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 569 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 572 aa  157  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 555 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 587 aa  157  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 569 aa  157  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 		 556 aa  156  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 573 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 563 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 555 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 573 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 559 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  26.45 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>