268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2166 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2166  thymidylate synthase  100 
 
 		 342 aa  702    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2987  thymidylate synthase  70.76 
 
 		 342 aa  525  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1682  thymidylate synthase  71.64 
 
 		 338 aa  524  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3006  thymidylate synthase  71.93 
 
 		 334 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1609  thymidylate synthase  50.43 
 
 		 289 aa  332  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.536162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  37.79 
 
 		 264 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  37.79 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5412  thymidylate synthase  38.01 
 
 		 262 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  42.74 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  35.76 
 
 		 264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  35.94 
 
 		 277 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  38.37 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  36.1 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  37.21 
 
 		 264 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  35.47 
 
 		 264 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  40.07 
 
 		 264 aa  199  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  42.34 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  44.35 
 
 		 264 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  36.36 
 
 		 285 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  35.47 
 
 		 264 aa  197  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  43.55 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  38.08 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  37.5 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  43.95 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  41.3 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  43.95 
 
 		 264 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  36.05 
 
 		 264 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  39.8 
 
 		 264 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  41.94 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  36.34 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  35.76 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  36.34 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  36.99 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  34.8 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  41.94 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  34.88 
 
 		 264 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  37.21 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  37.24 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  41.53 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  36.63 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  36.63 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  42.08 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  40.32 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  36.34 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  37.21 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  34.59 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  41.94 
 
 		 264 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  42.5 
 
 		 264 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  36.34 
 
 		 264 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  35.26 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  36.18 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  45 
 
 		 264 aa  189  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  36.34 
 
 		 264 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  36.95 
 
 		 290 aa  189  8e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  34.01 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  35.47 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  35.85 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  34.73 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  41.67 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  36.47 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  41.67 
 
 		 264 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  39.92 
 
 		 264 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  35 
 
 		 265 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  35.19 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  36.44 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  44.17 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  33.72 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  42.92 
 
 		 264 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  35.01 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  34.3 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  41.25 
 
 		 264 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  36.05 
 
 		 264 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  36.55 
 
 		 265 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  40.84 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  36.49 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  34.9 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  36.95 
 
 		 290 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  34.3 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  42.44 
 
 		 271 aa  182  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  34.01 
 
 		 264 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  42.62 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  42.98 
 
 		 264 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  41.11 
 
 		 274 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>