55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1965 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1965  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.525919  normal  0.107864 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0015  hypothetical protein  62.14 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.749123  normal  0.735354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2025  hypothetical protein  59.34 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  28.23 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  35.24 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  37.14 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  36.45 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  35.24 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  36.19 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  34.29 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  36.19 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  36.19 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  28.9 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  36.19 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  36.19 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  35.24 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  34.29 
 
 		 184 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  34.29 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  31.28 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  32.38 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  27.94 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  26.79 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  33.7 
 
 		 185 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  26.37 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  27.1 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  40 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  32.61 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  36.96 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  35.16 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  26.82 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  23.62 
 
 		 187 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  29.35 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  23.44 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  37.63 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  23.62 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  37.63 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  37.63 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  25.49 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  26.63 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  26.64 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  24.07 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  36.56 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  28.12 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  26.87 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  32.1 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  26.61 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  27.15 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  35.48 
 
 		 218 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  34.74 
 
 		 190 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  28.87 
 
 		 203 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  35.48 
 
 		 218 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  26.86 
 
 		 302 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  37.21 
 
 		 192 aa  42  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>