79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1633 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1633  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 221 aa  413  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.965631  normal  0.349728 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3708  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  64.71 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5227  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.45 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3057  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  56.82 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.74 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.7 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.25 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.88 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.85 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.89 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.05 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.32 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.51 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0826  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.05 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.33 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.8 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.88 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.12 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.14 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  28.23 
 
 		 396 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.05 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.59 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.31 
 
 		 341 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  25.45 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.92 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.24 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.89 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.71 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2317  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.22 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000398052  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.44 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  27.88 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.11 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2904  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.04 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.21 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.14 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.63 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2163  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.33 
 
 		 306 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0104507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.46 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.05 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2672  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.75 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  29.27 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.07 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.3 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.09 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.18 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  25.55 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.91 
 
 		 257 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.3 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.52 
 
 		 256 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.17 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.13 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  24.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.13 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.13 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0051  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.25 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.72 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.07 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02950  cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.84 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.6 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.08 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24250  cytochrome c biogenesis protein  30.82 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0600094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.44 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.79 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.37 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0690  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.11 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0867  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.57 
 
 		 264 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265338  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07210  cytochrome c biogenesis protein  46.81 
 
 		 274 aa  41.6  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.58 
 
 		 244 aa  41.6  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>